Masa depan yang jauh, 5012.
Invasi udara mendadak ke Bumi oleh <Alien> dan
ciptaan mereka <Machine Lifeforms> membawa umat manusia ke ambang kepunahan.
Jumlah manusia yang bertahan yang berlindung di bulan untuk mengatur serangan balik menggunakan
<android> tentara untuk merebut kembali Bumi.
Namun, perang menemui jalan buntu karena <Bentuk Kehidupan Mesin> terus berkembang biak tanpa batas.
Pada gilirannya, umat manusia mengerahkan unit tentara android baru sebagai senjata pamungkas: <YoRHa>
Baru dikirim ke Bumi <2B> bergabung<9S>, analis yang saat ini ditempatkan di sana, di mana selama misi mereka, mereka menghadapi segudang fenomena misterius...
Ini adalah kisah tentang <android> yang tak bernyawa dan perjuangan mereka yang tak ada habisnya demi umat manusia.
(Sumber: Situs Resmi NieR:Automata Ver1.1a AS)
Catatan: Episode 9, 10, 11, 12 ditayangkan berturut-turut pada tanggal 23 Juli 2023.